營業(yè)稅改征增值稅試點(diǎn)政策中的一項(xiàng)重要內(nèi)容就是在現(xiàn)行增值稅17%和13%兩檔稅率的基礎(chǔ)上，增設(shè)11%、6%兩檔低稅率?！敦?cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于在上海市開展交通運(yùn)輸業(yè)和部分現(xiàn)代服務(wù)業(yè)營業(yè)稅改征增值稅試點(diǎn)的通知》(財(cái)稅〔2011〕111號)規(guī)定，交通運(yùn)輸業(yè)(陸路運(yùn)輸服務(wù)、水路運(yùn)輸服務(wù)、航空運(yùn)輸服務(wù)、管道運(yùn)輸服務(wù))適用11%的稅率;研發(fā)和技術(shù)服務(wù)、信息技術(shù)服務(wù)、文化創(chuàng)意服務(wù)、物流輔助服務(wù)、鑒證咨詢服務(wù)等現(xiàn)代服務(wù)業(yè)適用6%的稅率。

　　目前上海市運(yùn)輸業(yè)有兩種發(fā)票，一種是《公路、內(nèi)河貨物運(yùn)輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票》，主要是實(shí)行簡易征收的貨運(yùn)試點(diǎn)納稅人使用，此類發(fā)票到2012年3月底結(jié)束使用，從4月1日開始，統(tǒng)一使用《上海市國稅通用機(jī)打發(fā)票》，一般納稅人收到此類發(fā)票的，按原抵扣方法保持不變。另一種是《貨物運(yùn)輸業(yè)增值稅專用發(fā)票》，根據(jù)財(cái)稅〔2011〕111號文件規(guī)定，提供交通運(yùn)輸業(yè)服務(wù)，運(yùn)輸費(fèi)稅率為11%。企業(yè)取得上海市一般納稅人開具的《貨物運(yùn)輸業(yè)增值稅專用發(fā)票》，按取得的增值稅專用發(fā)票上注明的增值稅額為進(jìn)項(xiàng)稅額，準(zhǔn)予從銷項(xiàng)稅額中抵扣。

　　一是貨物運(yùn)輸抵扣憑證的變化，從2012年1月1日(含)以后，全國的增值稅一般納稅從試點(diǎn)地區(qū)取得可抵扣的運(yùn)輸費(fèi)用憑證，應(yīng)是《貨物運(yùn)輸業(yè)增值稅專用發(fā)票》(鐵路運(yùn)輸費(fèi)用結(jié)算單據(jù)除外)，其他運(yùn)輸費(fèi)用結(jié)算單據(jù)一律不得作為增值稅扣稅憑證。二是一般納稅人取得的增值稅專用發(fā)票，無論是否屬于可抵扣范圍，都必須先認(rèn)證，否則會游離于整個(gè)增值稅抵扣鏈條之外，造成滯留發(fā)票。三是受票方要注意鑒別真假發(fā)票，《國家稅務(wù)總局關(guān)于啟用貨物運(yùn)輸業(yè)增值稅專用發(fā)票的公告》(國家稅務(wù)總局公告2011年74號)第三項(xiàng)第五款明確界定了發(fā)票代碼和發(fā)票號碼的編制原則，依據(jù)此原則，增值稅一般納稅人2012年1月1日(含)以后從試點(diǎn)地區(qū)取得的《貨物運(yùn)輸業(yè)增值稅專用發(fā)票》的代碼是3100111730，發(fā)票號碼的前兩位或四位應(yīng)是11或2011。